称念寺と号し、もと土肥山のふもとにあり、文亀元年、教蓮社円誉琳琢上人が現在地に移して再興、明暦3年、本覚寺と改称した。 明治29年、33年に類焼し、明治36年10月に再建された。 境内に「鏡山あだ討ち」で有名な、「お初」及び俳人「菊舎尼」の墓碑がある。